演讲摘要：一寸光阴一寸金，生物信息学中的数据分析往往是比较耗时的，但是借助于传统分布式高性能计算平台来加速生物数据处理又需要大量的资金、人力投入。本报告以团队研发的高性能分子动力学模拟软件、高性能组学大数据处理软件为例，介绍了在有限硬件资源下、在超算平台以及常见的服务器或者工作站平台上如何通过高性能计算相关技术来加速生物数据处理与计算模拟。在相同硬件环境下，经过深度优化的高性能软件可以将数据处理与计算模拟速度提升一到两个数量级。
讲者简介：山东大学教授，博士生导师，CCF高性能计算专委委员，CCF生物信息学专委委员，其研究领域为高性能计算、大数据处理与分析。迄今为止以第一作者或通讯作者发表学术论文60余篇，发表在包括著名国际期刊如IEEE TPDS, Bioinformatics，IEEE TCBB, BMC Bioinformatics, Computational and Structural Biotechnology Journal，Journal of Computational Biology和著名国际会议如SC, FAST, NSDI, IPDPS, ICPP, BIBM, IEEE Cluster等。其中，所发表的关于使用GPU处理器进行生物大数据处理的论文曾两次获得德国Fraunhofer IGD的最佳论文一等奖,2016 CCF高性能计算学术会议最佳论文奖,2017年ACM“戈登•贝尔”奖。目前承担了包括科技部国家重点研发计划、国家自然科学基金面上项目、国家自然科学基金山东联合基金、中德合作科研项目（PPP）等国家和省部级重要科研项目。
第五届中国计算机学会生物信息学会议
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