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演讲摘要:DNA甲基化是一类重要的表观遗传修饰,大量研究表明,DNA甲基化的异常与肿瘤的发生、发展都有着密切的联系。本次报告将介绍基于DNA甲基化芯片数据的肿瘤细胞纯度估计方法,以及如何利用估计出的肿瘤纯度进行下游功能分析,包括考虑纯度的肿瘤与正常样本的差异甲基化分析、不同肿瘤亚型的差异甲基化分析,以及肿瘤样本聚类方法等。我们将上述所有方法整合为在线分析工具purimeth.
讲者简介:上海师范大学数学系教授,博士生导师。主要从事生物信息学领域的研究,在基于DNA甲基化 (包括亚硫酸盐测序和450k芯片数据) 的肿瘤纯度估计、校正肿瘤纯度的差异甲基化分析及肿瘤样本聚类等问题上取得了一系列研究成果。2008年至今累计发表SCI论文60余篇,包括第一或通讯作者论文40余篇,累积影响因子超过300。以负责人承担国家自然科学基金面上项目2项,青年项目1项,以项目骨干承担国家重点研发计划专项1项。现任中国计算机学会生物信息专业委员会委员,中国抗癌学会肿瘤标志物专业委员会肿瘤测序及大数据分析协作组常务委员,中国现场统计研究会大数据统计分会理事等。